为了适应加入世界贸易组织的需要，履行Trips协议规定的义务，我国在2001年对《商标法》进行了第二次修正，增加了地理标志保护的条款。这些条款在2013年《商标法》第三次修正中予以保留。
在我国，地理标志可以作为证明商标或集体商标受到保护。按照2013年修正后的《商标法》第16条第2款之规定，地理标志是指“标示某商品来源于某地区，该商品的特定质量、信誉或者其他特征，主要由该地区的自然因素或者人文因素所决定的标志”。《商标法实施条例》第4条规定：“《商标法》第16条规定的地理标志，可以依照《商标法》和本条例的规定，作为证明商标或者集体商标申请注册。”
作为集体商标、证明商标申请注册的地理标志，可以是该地理标志所标示的地区的名称，也可以是能够标示某商品来源于该地区的其他可视性标志，而地区名称无需与该地区的现行行政区划名称、范围完全一致。但是，《商标法》第16条第1款规定：“商标中有商品的地理标志，而该商品并非来源于该标志所标示的地区，误导公众的，不予注册并禁止使用；但是，已经善意取得注册的继续有效。”
以地理标志作为证明商标注册的，其商品符合使用该地理标志条件的自然人、法人或其他组织可以要求使用该证明商标，控制该证明商标的组织应当允许。以地理标志作为集体商标注册的，其商品符合使用该地理标志条件的自然人、法人或其他组织，可以要求参加以该地理标志作为集体商标注册的团体、协会或其他组织，该团体、协会或其他组织应当依据其章程接纳为会员；不要求参加以该地理标志作为集体商标注册的团体、协会或其他组织的，也可以正当使用该地理标志，该团体、协会或其他组织无权禁止。
被注册为证明商标或集体商标的地理标志受到商标法的保护。
为了履行Trips协议关于葡萄酒和烈性酒地理标志特殊保护的规定，2003年颁布实施的《集体商标、证明商标注册和管理办法》对葡萄酒和烈性酒地理标志的附加保护作了特别规定。该办法第12条规定，对于“使用他人作为集体商标、证明商标注册的葡萄酒、烈性酒地理标志标示并非来源于该地理标志所标示地区的葡萄酒、烈性酒，即使同时标出了商品的真正来源地，或者使用的是翻译文字，或者伴有诸如某某‘种’、某某‘型’、某某‘式’、某某‘类’等表述的”行为，应当予以禁止。