企业知识产权管理的组织机构是企业知识产权管理体系的基础。加强企业知识产权组织管理，建立完善的企业知识产权管理制度，明确界定知识产权的管理部门、所辖关系、职权范围以及奖惩责任，任用高层次、高素质、知识结构多元化的知识产权管理人员,通过高质量的组织建设，是保障企业知识产权有效管理的基础。企业知识产权管理组织机构的设置一般有三种可供选择的方式：①隶属于产品技术研发部门，即在产品技术研发部门之下设置知识产权管理部。②宜属于决策层，即知识产权管理部门直接设在总经理之下，与法务部门平级。③隶属于法务部门.知识产权管理人员与法务人员同属于法务部门.知识产权管理人员有时兼任法务人员。对于企业知识产权内部事务的管理则可以采取集中管理制、分散管理制和行列式管理制三种典型的模式。企业知识产权战略管理部门的主要职能包括：知识产权战略管理；知识产权研讨培训；知识产权日常管理；知识产权纠纷处理；知识产权信息管理；知识产权经营管理；知识产权交流合作和知识产权激励管理。