一般而言，“价值”一词主要表达的是人类生活中一种普遍的主客体关系，即客体的存在、属性和变化与主体需要之间的关系。由此可推论，地理标志的价值即体现为地理标志与权利人以及社会公众之间需要与满足的关系。其中，效益的提升，是法律追求的价值之一，高效率的交易是经营者信誉的提升和经济利益的实现，这是地理标志效益价值的体现；秩序的维护，是法律的价值之一，而法律在促成社会秩序的形成和发展方面同样发挥着重要作用；利益的均衡，符合条件的经营者均可以向地理标志注册人提出使用申请，而地理标志注册人无正当理由不得拒绝，这种机制平衡了利益关系。
地理标志的价值就是地理标志保护制度的目标，透过地理标志的标识本身，考量地理标志产品的纵深产业及其对当地经济文化社会的影响，再延伸到人类文明发展的历史轨迹，可见地理标志的价值是多元的：（１）提升竞争力、推动产业化。从与同类产品的竞争来看，地理标志标识的产品或商品，因其特定品质和知名度，一般都比同类商品具有更高的市场价值，有的地理标志产品价格是同类产品的几倍甚至几十倍；从地理标志产品的产业来看，涉及从种植、栽培、采收、加工、运输到销售等众多环节，形成多达几万人甚至几十万人的产业链，形成一定区域的经济发展的支柱产业。
要重点扶持和积极促进高原特色农业发展，打造优质农产品商标品牌，要将云南省的云茶、云花、云菜、云果、云药等云系农产品，通过地理标志证明商标“打造一个品牌、兴旺一方产业、富裕一方百姓”，引领一方经济的发展。
例如，云南的地理标志证明商标“普洱茶”。“普洱茶”在短短的时间内异军突起，使得云南茶业的发展获得了前所未有的机遇，推动云南茶业跨上了一个新台阶。数以百万计的茶农、制茶企业、茶叶经销商形成了一个群体和产业，带动了区域经济的发展。据云南省茶叶协会提供的数据显示：“２０１０年，全云南省茶园面积达到５６０万亩，采摘面积４０３万亩，茶叶产量２００２万吨，面积和产量排名全国第一。茶叶工农业总产值１００７亿元。云南茶叶出口也呈现可喜局面，出口额达１５３４万美元，同比增长１４２％。据不完全统计，目前云南省初制所（厂）有５６４４家，精制厂１０００多家，生产能力突破２５万吨。茶农达６００万，涉茶人数逾千万人。”（２）传播文明、促进和谐。传统知识对人类文明的发展具有重要作用，但近年来传统知识引起人们的普遍重视则是基于谋求发达国家和发展中国家的和谐发展。地理标志作为传统知识的典型代表，在促进产业链的上游、中游、下游等各个产业环节上的从业者的和谐发展、促进经济发达地区和欠发展地区的和谐发展、促进发达国家和发展中国家的和谐发展中具有重要的现实作用和潜在价值。
例如，闻名遐迩的“普洱茶”，２００５年前后，由云南茶业企业组织的云南普洱茶马帮进京入沪、出广州、赴青岛等声势浩大的长途之旅，将云南的普洱茶驮到了中国的大江南北，一度掀起了前所未有的普洱茶营销高潮，在那渐行渐远的马蹄声中，人们“再次见到了消失多年的马锅头，听到了那远久而熟悉的暮色中的蹄铃声，看到了晚霞中的普洱茶”，由此彰显了云南的民俗风情，宣传了普洱茶文化，连接了上游产业与下游产业的环节，促进了普洱茶产业的发展。
（３）维持生态、持续发展。地理标志产品大都具有悠久的历史传统，是该地域土地资源的沉淀和升华。这些承载着地域土地精华的特色产品，是当地人民经过几百年上千年的摸索而寻找到的与当地的土地等自然环境和谐统一的最佳结合点。这种适地适种的和谐统一，切实地体现并实践着现代农业科技所强调的特色经济和可持续发展的时代要求。
（４）保护独特文化、多元文化并存。地理标志作为传统知识的典型代表，实际上也是人类的文明成果和特定区域内的独特文化表现，这种特定地域内的文化，既包含了自然环境、生物品种等物质文化，也包含了与当地自然环境和谐统一的独特的非物质文化因素。诸如具有地域特色的种植习惯、加工工艺以及人与自然和谐相处的习惯等。地理标志的保存、发展、保护了文化的多样性，促进了文化的繁荣。