（一）组织机构
韩国专利法院在韩国司法体系中属于专门法院（韩国司法体系包括普通法院、专门法院和特别法院），审级为行政一审法院和民事二审法院（自２０１６年１月１日，韩国专利法院开始受理涉及专利权、商标权、植物新品种权的侵权上诉案件），由大法官、主审法官、法官、技术调查官等司法人员组成。在组织机构上，韩国专利法院下设５个审判部门，每个审判部门由１名主审法官和２名法官组成，同时设置秘书处负责日常行政事务。在５个审判部门之上，专利法院设置审判委员会，主要职责在于对法院的司法事务提出参考建议。
为了保证审判专业水准，韩国专利法院拥有１７名技术审查官，都是长期工作在机械工程、电子工程、化学工程与生物工程等各学科领域、具有丰富实践经验的技术专家，在诉讼过程中可以为审理法官提供专业咨询意见。根据《韩国法院组织法》，担任专利法院的技术审查官必须具备下列条件之一：具有５年以上业务经验的韩国知识产权局工作人员；工作年７年以上，同时具有５年以上工业和科学技术相关的工作经验且任职资格５级以上的政府工作人员；具有硕士学位同时具有１０年以上某一技术领域工作经验；具有相关技术领域博士学位；依法取得国家工程证书人员。可以看出，韩国专利法院对于技术审查官的任职资格要求非常严格，以确保法官在庭审过程中能够在明确技术事实基础上准确适用法律。
（二）管辖范围
基于韩国原有三级确权救济机制在使用过程中存在若干问题，韩国专利法院成立以后，确权救济机制也相应进行了调整。原有专利审判院和专利抗诉审判院合并成立知识产权审查委员会（ＩＰＴ），对韩国知识产权局（ＫＩＰＯ）确权决定不服的，首先应当向知识产权审查委员会提出复审，对复审结果仍然不服的，可以向专利法院提起行政诉讼，对诉讼结果不服可以向韩国最高法院上诉。可以看出，韩国设立专利法院的初衷在于解决专利权、实用新型权利、外观设计权、商标权②在确权过程中产生的行政诉讼问题，因此自１９９８年成立到２０１６年以前，韩国专利法院的管辖范围仅涉及单一确权行政诉讼以及依据《法院组织法》由专利法院专属管辖的案件。这一状况在２０１５年出现了重大转折，２０１５年１１月１２日，韩国国会通过了包含有关专利法院集中管辖的重大改革内容的《韩国法院组织法》及《韩国民事诉讼法》的修正案，主要内容是由专利法院专属管辖专利权、商标权、植物新品种保护权相关的侵权诉讼案件的二审，该改革内容从２０１６年１月１日开始施行。①自此，韩国专利法院的管辖范围涵盖确权类一审行政诉讼和二审侵权诉讼，审理模式由原来的单一确权制转变为知识产权民事、行政“二审合一”，是韩国知识产权司法体制改革中的重要转折点。