商标是能够将一个企业的商品或者服务同其他企业的商品或者服务区别开来的标志。换言之，商标是一种用于商品上或者服务中的特定标记，消费者通过这种标记，识别或者确认该商品、服务的生产经营者和服务提供者。在药品领域，商标是消费者购买药品的主要驱动力。药品作为一种特殊商品，消费者重点关注的是它的功效与安全性，但是消费者并不具备判别药品质量的能力，因此就将注意力转向了商标，尤其在一个具有众多类似品种的市场中，有无商标、商标形象如何成为消费者购买与否的主要判别指标。尽管没有一个医药商标可以没有安全性和疗效而取得成功，但商标对与消费者之间建立情感纽带是重要的，良好的医药商标带来医师和患者的认识可发挥产品上市后的最大潜能。因此商标对于企业来说是一种重要的无形资产，对商标专用权的确认和保护也因此成为必然。此外对药品商标权的保护对于指导安全合理用药、保障人们身体健康也有着重要的意义。就商标权的法律保护与专利权的法律保护的关系而言，前者保护着新产品或新产品的制作方法，后者则保护着产品来源的信誉，指示着产品的质量。实际上一个企业往往利用商标和专利的双重保护来加强自己在某种产品市场上的垄断地位。
与药品商标有关的一个概念是药品的通用名。一般来说，所谓药品名称包括通用名和商品名。药品的通用名称是指一国国家药品标准所规定的相同药品所共有的名称；药品的商品名称是一个企业生产的药品所特有的名称。同一通用名称的药品可以有不同的商品名称。药品的商品名称可以申请注册商标，而药品的通用名称是不允许申请注册商标的。为了避免将药品的通用名称与商品名称相混淆，尤其是为了避免把知名的药品商标当作药品名称使用，目前各国商标注册机关均以世界卫生组织（ＷＨＯ）出版的《不要把非专利药名当作商标注册专用的建议》（ＩＮ－ＤＥＸＮＯＭＩＮＵＭ１９８０，ＩＮＮ）作为审查药品商标的权威依据。世界卫生组织出版的这部书，上面按英文２６个字母顺序列有各种药品专用药名，其中有很多药品名称的下面还列有字体较小的若干个药厂生产的同上面的这种药品有同一疗效的药品，并列有该药厂自己专门使用的注册商标。这种小字体的商标后面，一般都带有一个?标记，注明它们是注册商标，同时说明带有这些商标的药品，其疗效和上面带名称的药品相同。此外，实践中加强药品监督部门与工商管理部门之间的行政协调也很重要。