会计师事务所的商标专用权出现被侵权时，可以根据被侵权的不同情形、不同程度采取行政、民事、刑事等方式，以救济其权利被侵害。
1.向行政机关投诉，使侵权人获得行政处罚
对侵犯注册商标专用权的，任何人可以向侵权人所在地或者侵权行为地县级以上工商行政管理机关控告或者检举。商标注册人向工商行政管理机关投诉，请求保护其商标专用权的，应当递交书面投诉申请，同时附送其有效的权利证明，如侵权嫌疑人名称、地址，涉嫌侵权行为的发生地，涉嫌侵权的商标标识或者物品（包括但不限于照片、影印资料等）等等。
工商行政管理机关对尚未构成犯罪的侵权案件作出行政处理，对涉嫌构成犯罪的侵权案件移送司法机关追究侵权人的刑事责任。
2.提起民事侵权诉讼，排除妨碍，获得损失赔偿
对侵犯注册商标专用权的行为，被侵权人也可以直接向人民法院提起民事侵权诉讼。人民法院通过审判程序，维护商标专用权人的合法权益。
据路透社2018年4月3日消息，阿里巴巴集团向美国法院提起诉讼，指控迪拜一家公司使用一种名为”阿里巴巴币”的加密货币筹资逾350万美元，涉嫌侵犯其商标权。在提交至美国曼哈顿地方法院的起诉书中，阿里巴巴表示，阿里巴巴币基金会以“明显、反复和蓄意误导”的方式使用其注册商标，令用户产生混淆，误认为其产品附属于阿里巴巴，或是得到了阿里巴巴的支持。这是跨国企业就其商标专用权被侵犯而运用法律武器保护自身的例证。
为充分有效保护商标专用权人的知识产权，我国法律规定了诉前禁令制度。即在起诉前，根据《中华人民共和国商标法》、《最高人民法院关于诉前停止侵犯注册商标专用权行为和保全证据适用法律问题的解释》等规定，商标注册人或者利害关系人可以向人民法院提出诉前责令停止侵犯注册商标专用权行为或者保全证据的申请。
我国法律对于商标侵权赔偿也比一般的民事侵权规定的赔偿更为具体，保护更为到位。对于侵犯商标专用权的赔偿数额，可按照权利人因被侵权所受到的实际损失确定；实际损失难以确定的，可以按照侵权人因侵权所获得的利益确定；权利人的损失或者侵权人获得的利益难以确定的，参照该商标许可使用费的倍数合理确定。对恶意侵犯商标专用权，情节严重的，可以在按照上述方法确定数额的一倍以上三倍以下确定赔偿数额。赔偿数额应当包括权利人为制止侵权行为所支付的合理开支。权利人因被侵权所受到的实际损失、侵权人因侵权所获得的利益、注册商标许可使用费难以确定的，由人民法院根据侵权行为的情节判决给予300万元以下的赔偿。
3.追究刑事责任
商标侵权达到一定的追诉标准，可能构成刑事犯罪，商标专用权人可以向公安机关报案或根据工商机关移送，并最终将侵权人判处刑罚。