驰名商标的认定有两种程序或方式，一是主动认定，二是被动认定。所谓主动认定，又称为事前认定，是指认定机关根据自己掌握的有关商标的声誉和知名度的情况，主动将那些声誉较好、知名度高的商标认定为驰名商标。这种做法通常不是针对个案，常发生于国际上相互保护对方商标的国家之间。被动认定，是指在发生权益纠纷之后，应申请人的请求，有关主管机关对其商标是否为驰名商标作出的认定，又称为事后认定。又由于它是针对个案的认定，故又称为个案认定。

关于驰名商标的认定机构有两个选择：一是由法院认定，即通过司法程序认定；二是由行政机关认定，即通过行政渠道认定。在我国现行体制下，无论是法院还是国家行政管理部门都有权认定驰名商标。一般而言，行政机关的认定包括主动认定和被动认定两种方式，法院只采用被动认定的方式：因而，被动认定作为一种救济手段被普遍采用。