这里的大学研究机构是指与集群企业紧密互动的大学、本地的研究院所等，大学科研机构在区域经济发展中起着十分重要的作用，集群发展核心是大学、研究机构与产业之间关系的发展。David Birch(1987)在对斯坦福大学、麻省理工学院和其他一些高级研究机构所在区域的经济发展状况调查后发现，高校RD机构是集群技术创新过程中所需基础知识的重要来源，集群企业品牌网络的关系机理分析高级研究水平大学所在地区的增长率要高于国内平均增长水平。

大学科研机构通过四个途径促进集群企业品牌网络内的品牌提升。一是进行普遍的科学研究并影响企业的长期技术边界，提升企业的技术能力。高校RD机构的存在有助于知识的储备和增长，并为工业界提供不断增长的技术机会，从而加快技术应用性和发展性研究的速度。二是大学科研机构能够为品牌企业在管理创新方面提供充分的智力支持，为新产品、新技术进入市场提供丰富的市场信息和营销组合手段。Macpherson(1991)在对比分析美国128公路和硅谷等高新技术产业区时指出，集群服务机构的完备程度和产品创新的成功率高度相关。三是创造直接用于工业生产的知识(样机或新工艺等)。四是为企业创新提供主要的人力资源。大学科研机构通过输入学生、为品牌企业提供员工培训等方式间接输入先进技术和管理理念，从而促进品牌提升。

大学研究机构与企业之间的知识互动形式表现为正式和非正式途径等多种方式。正式途径主要有收购性学习、技术许可和企业衍生三种方式，其中收购性学习方式的地位最为重要。所谓收购性学习是指企业通过购买在企业自身认知系统内并不有效的知识以帮助自身充分利用企业资源。当品牌的发展面临重大问题时，如遇到重要的技术难题、管理变革问题，企业想快速获取新知识，就需要借助科研机构的力量进行收购性学习。

非正式途径主要表现为大学研究人员与集群企业相关人员的非正式联系。在本研究进行的一项调查中，多数企业的高学历技术人员认为，与大学中从事相关问题研究的导师、同学的交流是获取解决知识的重要途径，很多企业也很重视员工与大学科研机构专家的私人联系。本研究对河南安阳工程机械产业集群进行了调研，在对该集群中的企业高层经理进行访谈时得知，多数经理都与大学科研机构专家保持着紧密的私人联系，被调查者谈到，当出现技术问题时，大学科研机构的专家是首先被咨询的对象，并认为即使这些专家不能解决问题，也能够提供很多解决此类问题的信息。