地理标志与商标的联系表现在:首先，二者都属于识别性标记。地理标志与商标都使用在商品的包装或容器上，均有识别商品来源的功能。其次，有些国家运用商标法保护地理标志。比如我国《商标法》即规定可以将地理标志注册为集体商标或证明商标而获得保护，此时地理标志便成为了商标的一种。最后，地理标志的使用并不排斥商标的使用，即地理标志可以和商标同时使用在一件商品上，其中，地理标志用于表明商品的原产地，商标则用于区别同一地区内的不同生产者。

二者的区别主要体现在以下几个方面:

1.标示功能不同。商标表示的是商品生产者，以区别不同的生产者或服务者生产的同类商品或提供的同类服务;地理标志表示的则是商品的生产地，以区别不同地区所生产的同类商品。简言之，商标表明商品来自“何人”，而地理标志表明商品来自“何地”。

2.构成要素不同。普通商标不得使用直接描述商品产地、原料、功能、用途等的文字或图形，否则不能构成有效商标;地理标志则直接以地理名称来说明商品的地理来源，以此表明商品的内在优良品质。

3.权利性质和权利主体不同。商标权具有排他性，其权利主体是特定企业或个人;而地理标志不具有商标权意义上的排他性，它可以由多个生产经营者共同使用，只要这些企业设立在该地理区域，商品符合质量要求就可以使用。

4.权利内容不同。首先，商标可以转让，但地理标志与特定的地域不可分，因此不具可转让性;其次，商标可以自由许可他人使用，但地理标志如果被特定组织注册成为集体商标或证明商标后，其仅能许可该特定地区内符合特定生产条件的生产者使用。

5.保护期限不同。商标的注册有效期为10年，地理标志则具有永久性，不受时间限制。