企业知识产权冲突有不同地域（法域）间的权利冲突、知识产权各类权利之间的冲突和知识产权与其他类型权利间的冲突。对于知识产权冲突的解决，分为两个层次：一是国家层次,二是企业层次。对于国家而言，一方面是从立法角度，如何去完善国家的法律体系和具体的法律条文；另一方面是政府与政府之间通过谈判达成共识（如加入WTO时中美之间多回合的谈判），来解决不同地域（法域）间的知识产权冲突。对于企业而言，要解决知识产权冲突问题，最主要的是形成企业知识产权冲突管理机制，加强企业知识产权冲突管理，从根本上予以解决。对知识产权冲突的管理，最函要的是重视专利文献的检索。专利文献涉及面广，它不仅几乎囊括了授予专利的技术领域中的全部开发成果，还包括了大部分应用研究成果和部分基础研究成果，既包含产业的新技术动向，又可从中预测出市场和社会需要，更为重要的是，它明确载有该发明、技术、成果的权利所有者及法律状态。其次.企业要重视依法确权。大多数知识产权必须经过有关主管机关审核、颁证的程序加以认可，持有相应的证书文件，才能证明权利的归属。

在专利、商标制度中，设定了“申请在先”原则，在一般情况下，申请在先者将会可能获得权属证书,而后来的申请人将不能获得诸如《专利权证书》或《商标注册证》等专属证书。因此，在专利和商标领域存在着大量的抢注现象。所以企业要有依法确权的意识?要在第一时间对自己的专利、商标等知识产权进行申请、注册，这样即使遇有知识产权冲突也能使自己处于有利地位。第三，企业要积极维权。企业知识产权管理部门要通过多种途径和渠道时刻注意有无知识产权的冲突，这里主要研究他人对自己的侵权。当发现有侵权行为时，企业往往会想到采取诉讼的方式，以法律途径制止侵权，这反映出当前我国企业法律意识的增强，但诉讼方式有时并不一定是最好的选择。知识产权人应对自己解决权利冲突的方式进行经济分析，可以根据实际情况，以对方侵权为条件，收取知识产权使用费，既得到了补偿，同时又占有了市场，这与我国法律中规定的“强制许可制度”是吻合的。依照经济法的基本理论，强制许可实际上是国家安排下的“合作博弈”，强制许可制度的设计，不仅减少了交易的信息成本，而且减少了谈判成本，有助于实现精神、财产效益的最大化，这也达到了“充分利用人类的知识资源”的目标。当然，面对他人的恶意侵权，企业应当毫不犹豫地拿起法律武器，维护自己的合法权益。