商标注册证遗失商标专有权依然有效不影响商标使用，但商标证遗失后申请人将不能进行转让、续展、宽展，以及电商商城入驻等业务，因为以上业务办理都需要商标注册证作为证明文件进行业务办理。

《商标法实施条例》第七章第六十四条规定：《商标注册证》遗失或者破损的，应当向商标局提交补发《商标注册证》申请书。另外商标持有人需要项商标缴纳500元的商标补发规费。商标持有人应当在《商标公告》上刊登遗失声明，以避免遗失的《商标证》为他人不法之用。《商标证》是权利的象征，标志着商标持有人的商标专用权不可侵犯。所以，商标证遗失应当及时进行补发。