注册商标侵权的民事责任的方式在民事领域的注册商标侵权保护一般是通过追究侵权民事责任来实现的。
民事责任是指民事主体违反合同或不履行其他义务而应承担的法律后果。其最大的特点是补偿性，以此使受害人受到侵害的合法权益能够得到恢复或补偿。民事责任主要分为违反合同的民事责任和侵权的民事责任两种类型，侵犯注册商标专用权的民事责任属于后者。根据商标法第53条、民法通则第134条的规定，结合保护商标专用权的特点，注册商标侵权行为的民事责任具体承担方式为：停止侵害；赔偿损失；消除影响、恢复名誉；赔礼道歉。以上承担民事责任的方式，可以单独适用，也可以合并适用。人民法院审理注册商标侵权案件，除适用上述规定外，还可以予以训诫，责令具结悔过、收缴进行非法活动的财物和非法所得，并可以依照法律规定处以罚款、拘留等处罚。
最高人民法院在《关于贯彻执行（中华人民共和国民法通则）若干问题的意见（试行）》中，说明了对注册商标侵权行为的民事责任的承担方式：当事人在诉讼中用赔礼道歉方式承担了民事责任的，应当在判决中说明；在诉讼中发现与本案有关的违法行为需要给予制裁的，予以训诫，责令具结悔过、收缴进行非法活动的财物和非法所得，或依照法律规定予以罚款、拘留；除法律另有规定外，对公民处以罚款的数额一般为500元以下，拘留为15日以下；依法对法定代表人处以拘留制裁措施的，拘留时间为15日以下。