出版社著作权纠纷主要有：
１．出版社侵权
一类是单独侵权。单独侵权比较典型的是，出版社作为作品使用者未经许可行使了应当由著作权人行使的权利，从而侵犯作者或其他著作权人权益的侵权行为。
另一类是共同侵权。共同侵权即出版社与作者共同侵犯他人合法权益。在此类侵权纠纷中，出版单位既是侵权人，同时也是作者或供稿人侵权行为的受害者。
２．出版社被侵权
一类是侵犯专有出版权纠纷。侵犯专有出版权纠纷是指出版社通过合同取得的独家出版作品的权利被侵犯从而产生的纠纷。
另一类是侵犯版式设计专有使用权纠纷。版式设计是出版者在编辑加工作品时完成的劳动成果。出版者对其版式设计享有专有使用权，即除了出版者自己可以随意使用其版式设计外，其他人未经许可不得擅自按原样复制。侵犯版式设计专有使用权纠纷指因未经许可使用、模仿出版者所创作或合法取得的版式产生纠纷的案件。
出版是指将作品编辑加工后，通过复制手段制作复制品并将复制品面向公众发行的行为。现代意义的出版通常包括编辑、复制和发行三个环节。版式设计专有权所涉及的出版仅仅是指图书、期刊的出版，出版者仅仅是指图书出版单位、报社和杂志社。版式设计包括版面设计和装帧设计。版式设计专有权的权利内容为单纯的财产权，是指出版者自己使用或许可他人使用并获得报酬的权利，他人未经许可使用其版式设计，除法律另有规定以外，构成侵犯版式设计专有权的行为。在具体的审判实践中，侵犯版式设计专有权的行为较少单独出现，一般都是和侵犯专有出版权的行为共同出现。