首先，申请人应向国家工商局商标局提出申请。申请的文件包括：填写好的中国国际注册申请书一份，申请书一定要加盖公章、国内商标注册证（或初步审定公告）复印件一份、代理委托书、商标图样两张，若是彩色商标，需彩色商标图样两张。商标局收到手续齐备的申请文件后，即登记申请日期，编申请号，计算申请人所需缴纳的费用，向申请人发送《收费通知单》。
申请人接到《收费通知单》后，应尽快按数额缴纳费用，商标局只有在收到如数的汇款后，才会向国际局递交申请。如若两个月后商标局仍未收到汇款，便会将此申请文件及其他附件一并退还申请人，不再保留申请日期和申请号。
国际局如在商标局收到国际注册申请之日起，两个月之内收到商标局递交的商标注册申请，商标局的收文日期便是国际局的收文日期，也就是该商标的国际注册日期；如国际局在两个月之后收到该申请，国际局则将国际局收到该申请的日期作为收文日期和国际注册日期。
如申请人想要指定保护的国家既有“协定”成员国，又有“议定书”成员国，而在本国申请注册的商标还未取得注册，或者刚刚提交申请，申请人可先就“议定书”成员国提出国际注册申请，当该商标在本国注册后再就“协定”成员国提出后期领土延伸申请。这样既能申请商标国际注册，又能尽快取得商标注册保护，特别是当该国际注册申请是在国内注册申请提出六个月之内提出的，申请人还可要求优先权。