一、侵犯计算机软件著作权的认定
侵犯计算机软件著作权的认定不仅是个法律问题，更是一个技术问题。计算机软件开发过程中，除取得程序代码这一最终成果外，还包括数据结构、算法、用户界面、组织结构等内容。因介于代码与软件功能之间的部分基本上还是属于软件开发过程中的思想，而非软件的表达，故不属于保护范围。
“实质相似性加接触”原则是计算机软件侵权判断的原则。在二者实质相似的前提下，若有证据证实被告接触或可能接触了软件，一般就可以认定侵权成立。其步骤如下：
（１）对被控侵权软件与权利人的软件直接进行软盘内容对比或者目录、文件名对比。
（２）对两个软件的安装过程进行对比，注意安装过程中的屏幕显示是否相同。
（３）对安装后的目录以及各文件进行对比，包括对比文件名、文件长度、文件建立或修改的时间、文件属性等表面现象。
（４）对安装后软件使用过程中的屏幕显示、功能、功能键、使用方法等进行对比。
（５）对两个软件的程序代码进行对比。
其中，最主要的是程序代码比对阶段。目标程序同一性判断只是软件侵权判断的基础，在目标程序相同的情况下，还需进一步判断与目标程序相对应的两个软件的源程序是否同一。如果两个软件的源程序实质相似，则可判定两个软件相似，侵权行为成立。二、计算机软件著作权纠纷的解决途径
计算机软件著作权纠纷的解决途径包括：
１．调解
《著作权法》第五十四条第一款规定，著作权纠纷可以调解。调解，是纠纷当事人按照自愿的原则，在互相谅解的基础上达成协议解决纠纷的一种方法。当然，达成协议后，很可能也会出现一方反悔、不执行调解协议，调解失败，当事人还可以向人民法院提起诉讼，请求判决。
２．仲裁
《著作权法》第五十四条第二项规定：“......，也可以根据当事人达成的书面仲裁协议或者著作权合同中的仲裁条款，向仲裁机构申请仲裁。”仲裁，是仲裁机构依法行使的解决著作权纠纷的法律行为，具有最终的法律效力，只有一方不履行仲裁裁决，另一方才可以提起诉讼。
３．诉讼
诉讼是通过司法程序解决纠纷的方式，主要用于：当事人直接因著作权纠纷向人民法院诉讼解决；通过调解达不成协议或者一方在达成协议后反悔，另一方通过诉讼解决纠纷；一方不执行仲裁裁决，另一方提起诉讼解决。诉讼的时效期为二年，超过二年失去胜诉的机会。
软件著作权的诉讼时效与著作权受侵害时的诉讼时效都是两年。《最高人民法院关于审理著作权民事纠纷案件适用法律若干问题的解释》规定，侵犯著作权的诉讼时效为两年，自知道或者应当知道侵权行为之日起计算。权利人超过两年起诉的，如果侵权行为在起诉时仍在持续，在该期内，人民法院应当判决被告停止侵权行为；侵权损害赔偿数额应当自权利人向人民法院起诉之日起向前推算两年计算。