注册商标使用许可费的确定是商标使用许可合同的重要内容之一，也是引发商标使用许可双方当事人争议的重要因素之一。注册商标使用许可费原则上由双方协商确定。
一、商标使用许可费的确定因素
关于如何确定注册商标使用许可费，影响许可费的主要因素有以下几方面：
（１）商标的知名度；
（２）商标的许可使用方式；
（３）商标许可的时间、地域、商品范围；
（４）行业利润、前景。
二、商标使用许可费的计算方法
关于商标使用许可费的计算方法，常见的有以下几种：
（１）根据产品售价的百分比计算，通常为１％～５％；
（２）根据产品利润率计算；
（３）根据双方协商确定的一定数额计算。
三、商标使用许可费的支付方式
商标许可费的支付方式有以下几种：一次性支付或分期支付。付费的标准可以一次协商一个总数，也可以按照产品的产量或利润提成。一次全部支付许可费的方式对许可人非常不利，除非被许可人实力雄厚。另外一次性支付风险过大，一旦商标不能带来利润将血本无归。相对来说提成的方式比较可取，一方面不会占用太多资金，另外也便于根据商标的实施情况随机应变。