美国的创新生态系统是由行政、立法、司法三个系统不同程度地参与国家科学技术政策的制定及科技工作的管理。

（1）美国国会对创新生态系统的支持

国会负责各计划和项目的最终审批和预算，通过立法决定有关税收、知识产权和监管等政策的基本框架，任何与重要政策相关的问题，都必须由国会最终决定；行政部门只是掌握财政杠杆、具体执行各种科技计划和项目、制定科技预算、向国会提出立法建议，具体执行各项法案。

（2）美国司法部门的支持政策

司法部门在美国的宏观科技管理体制中发挥卜分重要的作用，司法部门拥有法律条文的最终决定解释权，比如：美国的微软公司是否构成垄断、其商业方法与专利是否合法、时代华纳和美国在线合并是否导致垄断等案件都是司法体系内部做出的决定。

（3）美国行政部门对创新生态系统的支持

美国的宏观科技管理部门主要是白宫、国会和各联邦部门。白宫与国会是美国科技决策的核心部门，也是各种政治势力争夺决策主导权的焦点，政府各联邦部门大都拥有相关的科技管理机构，其中较重要的联邦科技管理机构有国防部、商务部、国家航空航天局、农业部等。