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    GNU Parallel的具体使用

    它是什么?

    GNU Parallel是一个shell工具,为了在一台或多台计算机上并行的执行计算任务,一个计算任务可以是一条shell命令或者一个以每一行做为输入的脚本程序。通常的输入是文件列表、主机列表、用户列表、URL列表或者表格列表;一个计算任务也可以是一个从管道读取的一条命令。GNU Parallel会把输入分块,然后通过管道并行的执行。

    如果你会使用xargs和tee命令,你会发现GNU Parallel非常易于使用,因为GNU Parallel具有与xargs一样的选项。GNU Parallel可以替代大部分的shell循环,并且用并行的方式更快的完成计算任务。

    GNU Parallel保证它的输出与顺序执行计算任务时是一样的,这样就可以方便的把GNU Parallel的输出做为其它程序的输入。

    对于每一行输入,GNU Parallel会把这一行做为参数来运行指定的命令。如果没有给出命令,那么这一行会被当做命令执行。多行输入会并行的运行。GNU Parallel经常被用于替代xargs或者cat | bash。

    指南

    本教程展示了绝大多数GNU Parallel的功能。旨在介绍GNU Parallel中的一个选项,而非讲解真实世界中使用的例子。花一个小时的时间学习本教程,你会由此爱上上命令行。

    预备

    为了执行本教程中的示例,你首先需要做如下准备:

    parallel >= version 20130814

    安装最新版:

    (wget -O - pi.dk/3 || curl pi.dk/3/) | bash

    这条命令同时也会安装最新版的指南

    man parallel_tutorial

    本教程的大部分内容同时也兼容旧版本。

    abc-file

    生成文件:

    parallel -k echo ::: A B C > abc-file

    def-file

    生成文件:

    parallel -k echo ::: D E F > def-file

    abc0-file

    生成文件:

    perl -e 'printf "A\0B\0C\0"' > abc0-file

    abc_-file

    生成文件:

    perl -e 'printf "A_B_C_"' > abc_-file

    tsv_file.tsv

    生成文件:

    perl -e 'printf "f1\tf2\nA\tB\nC\tD\n"' > tsv-file.tsv

    num30000

    生成文件:

    perl -e 'for(1..30000){print "$_\n"}' > num30000

    num1000000

    生成文件:

    perl -e 'for(1..1000000){print "$_\n"}' > num1000000

    num_%header

    生成文件:

    (echo %head1; echo %head2; perl -e 'for(1..10){print "$_\n"}') > num_%header

    远程执行:ssh免密码登录$SERVER1和$SERVER2

    生成文件:

    SERVER1=server.example.com
    SERVER2=server2.example.net
    

    最后应该成功运行如下命令:

    ssh $SERVER1 echo works
    ssh $SERVER2 echo works
    

    使用 ssh-keygen -t dsa; ssh-copy-id $SERVER1 建立环境(使用empty pass phrase)

    输入源

    GNU Parallel的输入源支持文件、命令行和标准输入(stdin或pipe)

    单个输入源

    从命令行读取输入:

    parallel echo ::: A B C

    输出(由于任务以并行的方式执行,顺序可能会有所不同):

    A
    B
    C

    文件做为输入源:

    parallel -a abc-file echo

    输出同上。

    STDIN(标准输入)做为输入源:

    cat abc-file | parallel echo

    输出同上。

    多输入源

    GNU Parallel支持通过命令行指定多个输入源,它会生成所有的组合:

    parallel echo ::: A B C ::: D E F

    输出:

    A D
    A E
    A F
    B D
    B E
    B F
    C D
    C E
    C F

    多个文件做为输入源:

    parallel -a abc-file -a def-file echo

    输出同上。

    STDIN(标准输入)可以做为输入源中的一个,使用“-”:

    cat abc-file | parallel -a - -a def-file echo

    输出同上。

    可以使用“::::”替代 -a:

    cat abc-file | parallel echo :::: - def-file

    输出同上。

    ::: 和 :::: 可以混合使用:

    parallel echo ::: A B C :::: def-file

    输出同上。

    适配参数

    –xapply 从每一个输入源取一个参数:

    parallel --xapply echo ::: A B C ::: D E F

    输出:

    A D
    B E
    C F

    如果其中一个输入源的长度比较短,它的值会被重复:

    parallel --xapply echo ::: A B C D E ::: F G

    输出:

    A F
    B G
    C F
    D G
    E F

    改变参数分隔符

    GNU Parallel可以指定分隔符替代 ::: 或 ::::,当这两个符号被其它命令占用的时候会特别有用:

    parallel --arg-sep ,, echo ,, A B C :::: def-file
    

    输出:

    A D
    A E
    A F
    B D
    B E
    B F
    C D
    C E
    C F

    改变参数分隔符:

    parallel --arg-file-sep // echo ::: A B C // def-file

    输出同上。

    改变参数定界符

    GNU Parallel默认把一行做为一个参数:使用 \n 做为参数定界符。可以使用 -d 改变:

    parallel -d _ echo :::: abc_-file
    

    输出:

    A
    B
    C

    \0 代表NULL:

    parallel -d '\0' echo :::: abc0-file

    输出同上。

    -0 是 -d '\0' 的简写(通常用于从 find … -print0读取输入):

    parallel -0 echo :::: abc0-file

    输出同上。

    输入源中的结束值

    GNU Parallel支持指定一个值做为结束标志:

    parallel -E stop echo ::: A B stop C D

    输出:

    A
    B

    跳过空行

    使用 –no-run-if-empty 来跳过空行:

    (echo 1; echo; echo 2) | parallel --no-run-if-empty echo

    输出:

    1
    2

    构建命令行

    没有指定命令意味着参数就是命令

    如果parallel之后没有给定命令,那么这些参数会被当做命令:

    parallel ::: ls 'echo foo' pwd

    输出:

    [当前文件列表]
    foo
    [当前工作目录的路径]

    命令可以是一个脚本文件,一个二进制可执行文件或一个bash的函数(须用 export -f 导出函数):

    # Only works in Bash and only if $SHELL=.../bash
    my_func() {
     echo in my_func $1
    }
    export -f my_func
    parallel my_func ::: 1 2 3
    

    输出:

    in my_func 1
    in my_func 2
    in my_func 3

    替换字符串

    5种替换字符串

    GNU Parallel支持多种替换字符串。默认使用 {}:

    parallel echo ::: A/B.C

    输出:

    A/B.C

    指定 {} :

    parallel echo {} ::: A/B.C

    输出同上

    去掉扩展名 {.}:

    parallel echo {.} ::: A/B.C

    输出

    A/B

    去掉路径 {/}:

    parallel echo {/} ::: A/B.C

    输出:

    B.C

    只保留路径 {//}:

    parallel echo {//} ::: A/B.C

    输出:

    A

    去掉路径和扩展名 {/.}:

    parallel echo {/.} ::: A/B.C

    输出:

    B

    输出任务编号:

    parallel echo {#} ::: A/B.C

    输出:

    1
    2
    3

    改变替换字符串

    使用 -I 改变替换字符串符号 {}:

    parallel -I ,, echo ,, ::: A/B.C

    输出:

    A/B.C

    –extensionreplace替换 {.}:

    parallel --extensionreplace ,, echo ,, ::: A/B.C

    输出:

    A/B

    –basenamereplace替换 {/}:

    parallel --basenamereplace ,, echo ,, ::: A/B.C

    输出:

    B.C

    –dirnamereplace替换 {//}:

    parallel --dirnamereplace ,, echo ,, ::: A/B.C

    输出:

    A

    –basenameextensionreplace替换 {/.}:

    parallel --basenameextensionreplace ,, echo ,, ::: A/B.C

    输出:

    B

    –seqreplace替换 {#}:

    parallel --seqreplace ,, echo ,, ::: A B C

    输出:

    1
    2
    3

    指定位置替换字符串

    如果有多个输入源时,可以通过 {编号} 指定某一个输入源的参数:

    parallel echo {1} and {2} ::: A B ::: C D

    输出:

    A and C
    A and D
    B and C
    B and D

    可以使用 / // /. 和 .: 改变指定替换字符串:

    parallel echo /={1/} //={1//} /.={1/.} .={1.} ::: A/B.C D/E.F

    输出:

    /=B.C //=A /.=B .=A/B
    /=E.F //=D /.=E .=D/E

    位置可以是负数,表示倒着数:

    parallel echo 1={1} 2={2} 3={3} -1={-1} -2={-2} -3={-3} ::: A B ::: C D ::: E F

    输出:

    1=A 2=C 3=E -1=E -2=C -3=A
    1=A 2=C 3=F -1=F -2=C -3=A
    1=A 2=D 3=E -1=E -2=D -3=A
    1=A 2=D 3=F -1=F -2=D -3=A
    1=B 2=C 3=E -1=E -2=C -3=B
    1=B 2=C 3=F -1=F -2=C -3=B
    1=B 2=D 3=E -1=E -2=D -3=B
    1=B 2=D 3=F -1=F -2=D -3=B

    按列输入

    使用 –colsep 把文件中的行切分为列,做为输入参数。下面使用TAB(\t):

    1=f1 2=f2
    1=A 2=B
    1=C 2=D

    指定参数名

    使用 –header 把每一行输入中的第一个值做为参数名:

    parallel --header : echo f1={f1} f2={f2} ::: f1 A B ::: f2 C D

    输出:

    f1=A f2=C
    f1=A f2=D
    f1=B f2=C
    f1=B f2=D

    使用 –colsep 处理使用TAB做为分隔符的文件:

    parallel --header : --colsep '\t' echo f1={f1} f2={f2} :::: tsv-file.tsv

    输出:

    f1=A f2=B
    f1=C f2=D

    多参数

    –xargs 让GNU Parallel支持一行多个参数(可以指定上限):

    cat num30000 | parallel --xargs echo | wc -l

    输出:

    2

    30000个参数被分为两行。

    一行中的参数个数的上限通过 -s 指定。下面指定最大长度是10000,会被分为17行:

    cat num30000 | parallel --xargs -s 10000 echo | wc -l

    为了获得更好的并发性,GNU Parallel会在文件读取结束后再分发参数。

    GNU Parallel 在读取完最后一个参数之后,才开始第二个任务,此时会把所有的参数平均分配到4个任务(如果指定了4个任务)。

    第一个任务与上面使用 –xargs 的例子一样,但是第二个任务会被平均的分成4个任务,最终一共5个任务。

    cat num30000 | parallel --jobs 4 -m echo | wc -l

    输出:

    5

    10分参数分配到4个任务可以看得更清晰:

    parallel --jobs 4 -m echo ::: {1..10}

    输出:

    1 2 3
    4 5 6
    7 8 9
    10

    替换字符串可以是单词的一部分。通过下面两个命令体会 -m 和 -X 的区别:

    parallel --jobs 4 -m echo pre-{}-post ::: A B C D E F G

    输出:

    pre-A B-post
    pre-C D-post
    pre-E F-post
    pre-G-post

    -X与 -m 相反:

    parallel --jobs 4 -X echo pre-{}-post ::: A B C D E F G


    输出:

    pre-A-post pre-B-post
    pre-C-post pre-D-post
    pre-E-post pre-F-post
    pre-G-post

    使用 -N 限制每行参数的个数:

    parallel -N3 echo ::: A B C D E F G H

    输出:

    A B C
    D E F
    G H

    -N也可以用于指定位置替换字符串:

    parallel -N3 echo 1={1} 2={2} 3={3} ::: A B C D E F G H

    输出:

    1=A 2=B 3=C
    1=D 2=E 3=F
    1=G 2=H 3=

    -N0 只读取一个参数,但不附加:

    parallel -N0 echo foo ::: 1 2 3

    输出:

    foo
    foo
    foo

    引用

    如果命令行中包含特殊字符,就需要使用引号保护起来。

    perl脚本 'print “@ARGV\n”' 与linux的 echo 的功能一样。

    perl -e 'print "@ARGV\n"' A
    

    输出:

    A

    使用GNU Parallel运行这条命令的时候,perl命令需要用引号包起来:

    parallel perl -e 'print "@ARGV\n"' ::: This wont work

    输出:

    [Nothing]

    使用 -q 保护perl命令:

    parallel -q perl -e 'print "@ARGV\n"' ::: This works

    输出:

    This
    works

    也可以使用 ' :

    parallel perl -e \''print "@ARGV\n"'' ::: This works, too

    输出:

    This
    works,
    too

    使用 -quote:

    parallel --shellquote
    parallel: Warning: Input is read from the terminal. Only experts do this on purpose. Press CTRL-D to exit.
    perl -e 'print "@ARGV\n"'
    [CTRL-D]

    输出:

    perl\ -e\ \'print "@ARGV\n"'

    也可以使用命令:

    parallel perl\ -e\ \'print "@ARGV\n"' ::: This also works

    输出:

    This
    also
    works

    去除空格

    使用 –trim 去除参数两头的空格:

    parallel --trim r echo pre-{}-post ::: ' A '

    输出:

    pre- A-post

    删除左边的空格:

    parallel --trim l echo pre-{}-post ::: ' A '

    输出:

    pre-A -post

    删除两边的空格:

    parallel --trim lr echo pre-{}-post ::: ' A '

    输出:

    pre-A-post

    控制输出

    以参数做为输出前缀:

    parallel --tag echo foo-{} ::: A B C

    输出:

    A       foo-A
    B       foo-B
    C       foo-C

    修改输出前缀 –tagstring:

    parallel --tagstring {}-bar echo foo-{} ::: A B C

    输出:

     A-bar       foo-A

    以上就是本文的全部内容,希望对大家的学习有所帮助,也希望大家多多支持脚本之家。

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